La historia del Colegio comienza cuando una Madre española quien fundó la congregación de las "Esclavas de la Santísima Eucaristía y de la Madre de Dios", tuvo la idea de expander su obra y llegar hasta México; esa persona fue la "Madre Trinidad".
La Madre Trinidad mandó un grupo de religiosas de la congregación a México, las cuales empezaron con un Kinder muy chiquito llamado el "Kinder Conchita", el cuál estaba situado en Lerma, y posteriormente se cambió a una casa mas grande en la calle de Ebro.
En 1961 el colegio se cambió a la calle Rafael Alducín, en la col. Periodista. El colegio se construyó con muchos sacrificios, ayudas y donativos , así por fin se logró terminarlo y funcionó por 25 años.
El colegio era solo para niñas pero después se volvió mixto, y como el colegio empezó a ser chico se decidió buscar otro lugar; no se encontraba terreno y el que se llegaba a encontrar no era lo que se quería. Tres años pasaron antes de encontrar el terreno de lo que hoy es el "Colegio Miraflores".
Ya conseguido el terreno, este fue invadido 6 veces y una de ellas por 2000 personas que en menos de 24 horas armaron sus casas; todo esto era porque la gente se oponía a que se construyera el colegio.
Aunque muchas personas se opusieron se logró construir, porque era una obra de Dios, y es así como el Colegio Miraflores lleva trabajando mas de 30 años con magnificas instalaciones y mas de 2000 alumnos.
El nombre de Miraflores viene de la "Santísima. Virgen de Miraflores", porque la Virgen nunca abandona a sus hijos y aquí está el ejemplo de que a pesar de los problemas se logró ser: "La gran Familia Miraflores".
